【Rでベイズ統計学#4】ポアソン分布のベイズ推定

記事の目的

ポアソン分布のパラメータλのベイズ推定をRを使用して実装していきます。事前分布にはガンマ分布を指定して、事後分布を求めていきます。データの作成から実装するので、コピペで再現することが可能です。

 

目次

  1. ライブラリ
  2. 真の分布
  3. 事前分布
  4. データ
  5. 事後分布

 

1 ライブラリ

library(ggplot2)
set.seed(1)

 

2 真の分布

x <- 0:10
lambda <- 3
prob <- dpois(x, lambda)

ggplot() + 
  geom_bar(aes(x, prob), stat ="identity") +
  labs(x="x", y="prob", title="ポアソン分布")+
  theme_classic(base_family = "HiraKakuPro-W3") +
  theme(text = element_text(size = 24))

 

3 事前分布

a_pre <- 2
b_pre <- 1
x <- seq(0, 6, 0.01)
lambda_prob_pre <- dgamma(x, a_pre, b_pre)

plot <- ggplot()+
  geom_line(aes(x=x, y=lambda_prob_pre))+
  labs(x="λ", y="prob", title="ガンマ分布")+
  theme_classic(base_family = "HiraKakuPro-W3") +
  theme(text = element_text(size = 24))
plot

 

4 データ

data <- rpois(30, lambda)
N <- length(data)

 

5 事後分布

a_pos <- sum(data) + a_pre
b_pos <- N + b_pre
x <- seq(0, 6, 0.01)
lambda_prob_pos <- dgamma(x, a_pos, b_pos)

plot + geom_line(aes(x=x, y=lambda_prob_pos), col="blue")